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这个包适用于Bioconductor的3.12版本。这个包已经从生物导体公司拿走了。有关最新的稳定发布版本,请参见GGBase.
Bioconductor版本:3.12
基础设施
作者:VJ Carey
维护者:VJ Carey
引用(来自R,输入引用(“GGBase”)
):
要安装这个包,启动R(版本"4.0")并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("GGBase")
对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:
browseVignettes(“GGBase”)
超文本标记语言 | R脚本 | GGBase——GGtools的基础设施,基因表达的遗传学 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 遗传学,基础设施,软件 |
版本 | 3.52.0 |
在Bioconductor中 | BioC 2.2 (R-2.7)(13岁) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R(>= 2.14),方法;snpStats |
进口 | limma,genefilter,Biobase,BiocGenerics(> = 0.35.3),S4Vectors,IRanges,矩阵,AnnotationDbi,消化,GenomicRanges,SummarizedExperiment |
链接 | |
建议 | GGtools,illuminaHumanv1.db,knitr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
这取决于我 | ceu1kg,ceu1kgv,ceuhm3,dsQTL,GGdata,GGtools,hmyriB36,yri1kgv |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。
源包 | GGBase_3.52.0.tar.gz |
Windows二进制 | GGBase_3.52.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | GGBase_3.52.0.tgz |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/GGBase |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/GGBase |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/GGBase/ |
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