ggtools

doi:10.18129/b9.bioc.ggtools

此软件包适用于生物导体的3.12版。该软件包已从生物导体中删除。有关最后一个稳定的最新版本版本,请参阅ggtools

软件和数据用于分析基因表达的遗传学

生物导体版本:3.12

软件和数据,用于分析基因表达和/或DNA甲基化的遗传学

作者:vj Carey

维护者:vj Carey

引用(从r内,输入引用(“ ggtools”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ ggtools”)

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文档

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browsevignettes(“ ggtools”)

PDF R脚本 GGTools:用于EQTL标识的软件
PDF 参考手册
文本 读书我
文本 消息

细节

生物浏览 基因表达,,,,遗传因素,,,,遗传学,,,,SNP,,,,软件
版本 5.25.3
在生物导体中 Bioc 1.9(R-2.4)(14。5年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 2.14),GGBASE(> = 3.19.7),Data.Table, 平行,同性恋
进口 方法,utils,stats,生物基因(> = 0.25.1),snpstats,,,,ff,,,,rsamtools,,,,AnnotationDbi,,,,生物酶,,,,少量,,,,变体,,,,Hexbin,,,,rtracklayer,,,,GVIZ,stats4,S4VECTORS(> = 0.9.25),iranges,,,,GenomeInfodB,,,,基因组机(> = 1.29.6),迭代器,,,,生物弦,,,,rocr,,,,Biglm,,,,GGPLOT2,,,,RESHAPE2
链接
建议 ggdata,,,,Illuminahumanv1.db,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37,,,,多检验,,,,AOD,,,,rmeta
系统要求
增强 matrixeqtl,,,,foreach,,,,多帕尔,,,,Gwascat
URL
取决于我 ceu1kg,,,,eqtl
进口我 ceuhm3,,,,Genegeneinter
建议我 CGDV17,,,,DSQTL,,,,GGBASE,,,,Hmyrib36
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 ggtools_5.25.3.3.tar.gz
Windows二进制 ggtools_5.25.3.3.zip
MacOS 10.13(高山脉) ggtools_5.25.3.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ggtools
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/ggtools
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/ggtools/
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