此软件包适用于生物导体的3.12版。该软件包已从生物导体中删除。有关最后一个稳定的最新版本版本,请参阅ggtools。
生物导体版本:3.12
软件和数据,用于分析基因表达和/或DNA甲基化的遗传学
作者:vj Carey
维护者:vj Carey
引用(从r内,输入引用(“ ggtools”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ ggtools”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ ggtools”)
R脚本 | GGTools:用于EQTL标识的软件 | |
参考手册 | ||
文本 | 读书我 | |
文本 | 消息 |
生物浏览 | 基因表达,,,,遗传因素,,,,遗传学,,,,SNP,,,,软件 |
版本 | 5.25.3 |
在生物导体中 | Bioc 1.9(R-2.4)(14。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 2.14),GGBASE(> = 3.19.7),Data.Table, 平行,同性恋 |
进口 | 方法,utils,stats,生物基因(> = 0.25.1),snpstats,,,,ff,,,,rsamtools,,,,AnnotationDbi,,,,生物酶,,,,少量,,,,变体,,,,Hexbin,,,,rtracklayer,,,,GVIZ,stats4,S4VECTORS(> = 0.9.25),iranges,,,,GenomeInfodB,,,,基因组机(> = 1.29.6),迭代器,,,,生物弦,,,,rocr,,,,Biglm,,,,GGPLOT2,,,,RESHAPE2 |
链接 | |
建议 | ggdata,,,,Illuminahumanv1.db,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37,,,,多检验,,,,AOD,,,,rmeta |
系统要求 | |
增强 | matrixeqtl,,,,foreach,,,,多帕尔,,,,Gwascat |
URL | |
取决于我 | ceu1kg,,,,eqtl |
进口我 | ceuhm3,,,,Genegeneinter |
建议我 | CGDV17,,,,DSQTL,,,,GGBASE,,,,Hmyrib36 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | ggtools_5.25.3.3.tar.gz |
Windows二进制 | ggtools_5.25.3.3.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | ggtools_5.25.3.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ggtools |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/ggtools |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/ggtools/ |
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