GOSim

DOI:10.18129 / B9.bioc.GOSim

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见GOSim

GO术语与基因产物功能相似性的计算氧化石墨烯富集分析

Bioconductor版本:3.12

这个包实现了几个有用的函数,用于计算基于GO注释的GO术语和基因产物之间的相似性。此外,它还允许计算氧化石墨烯富集分析

作者:Holger Froehlich

维护者:Holger Froehlich

引文(从R内,输入引用(“GOSim”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("GOSim")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“GOSim”)

PDF R脚本 GOsim
PDF 参考手册

细节

biocViews 聚类通路软件
版本 1.28.0
在Bioconductor BioC 2.13 (R-3.0)(7.5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 GO.db注释
进口 org.Hs.eg.dbAnnotationDbitopGO集群flexmixRBGL矩阵corpcorRcpp
链接 Rcpp
建议
SystemRequirements
增强了 igraph
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 GOSim_1.28.0.tar.gz
Windows二进制 GOSim_1.28.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra) GOSim_1.28.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GOSim
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GOSim
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/GOSim/
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