GeneGeneInteR

DOI:10.18129 / B9.bioc.GeneGeneInteR

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见GeneGeneInteR．

在基因水平测试基因-基因相互作用的工具

Bioconductor版本:3.12

本包的目的是提出在病例-对照关联研究中测试基因-基因相互作用的几种方法。这种测试可以通过聚合SNP-SNP相互作用测试在SNP水平(SSI)或通过使用基因-基因多维度方法(GGI)方法来完成。该软件包还提供了图形显示结果的工具。 ．

作者:Mathieu Emily [aut, cre]， Nicolas Sounac [ctb]， Florian Kroell [ctb]， Magalie Houee-Bigot [aut]

维护者:Mathieu Emily < Mathieu。艾米丽在agrocampus-ouest.fr>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“GeneGeneInteR”)

PDF	R脚本	GeneGeneInteR介绍
PDF	R脚本	成对交互测试
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneticVariability，遗传学，GenomeWideAssociation，单核苷酸多态性，软件
版本	1.16.0
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(4.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 4.0)
进口	snpStats，mvtnorm，Rsamtools，igraph，kernlab，FactoMineR，IRanges，GenomicRanges，data.table， grDevices，图形，统计，utils，方法，GGtools
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	GeneGeneInteR_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	GeneGeneInteR_1.16.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	GeneGeneInteR_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GeneGeneInteR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GeneGeneInteR
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/GeneGeneInteR/
软件包下载报告	下载数据