基因组间

doi：10.18129/b9.bioc.genomicinmictractions

该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅基因组间。

处理基因组相互作用数据的实用程序

生物导体版本：3.12

处理基因组相互作用数据的实用程序，例如CHIA-PET或HI-C，带有相互作用信息的基因组特征，以及产生图和摘要统计数据。

作者：Harmston，N.，Ing-Simmons，E.，Perry，M.，Baresic，A.，Lenhard，B。

维护者：liz ing-simmons

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ GenoMicInteractions”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“基因组互相”）

html	R脚本	chiapet_vignette.html
html	R脚本	基因组互感
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	DataImport，，，，datarepresentation，，，，嗝，，，，基础设施，，，，软件
版本	1.24.0
在生物导体中	Bioc 3.0（R-3.1）（6。5年）
执照	GPL-3
要看	r（> = 3.5），互动集
进口	rsamtools，，，，rtracklayer，，，，基因组机（> = 1.29.6），iranges，，，，生物基因（> = 0.15.3），Data.Table，，，，Stringr，，，，GenomeInfodB，，，，GGPLOT2， 网格，栅格， 方法，Igraph，，，，S4VECTORS（> = 0.13.13），dplyr，，，，GVIZ，，，，生物酶，图形，统计，utils，grdevices
链接
建议	尼特，，，，生物使用，，，，测试
系统要求
增强
URL	https://github.com/computationalRegulationgenomicsicl/genomicInteractions/
取决于我
进口我	Cagefightr
建议我	芝加哥，，，，埃尔默，，，，塞文
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	GenomicInteractions_1.24.0.tar.gz
Windows二进制	GenomicInteractions_1.24.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	GenomicInteractions_1.24.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genomicintractions
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/Genomicictractions
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/genomicinteractions/
软件包下载报告	下载统计