hcamatrixbrowser

doi：10.18129/b9.bioc.hcamatrixbrowser

该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅hcamatrixbrowser。

从人类细胞图集项目中提取和管理矩阵数据

生物导体版本：3.12

HCAMATRIXBROWSER查询HCA矩阵端点以下载表达数据并返回标准的生物导体对象。它使用loomexperiment软件包提供下载为HDF5织机格式的矩阵数据。

作者：Marcel Ramos [AUT，CRE]，Martin Morgan [AUT]（0000-002-5874-8148）

维护者：Marcel Ramos

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ hcamatrixbrowser”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ hcamatrixbrowser”）

html	R脚本	HCAMATRIX API查询
html	R脚本	hcamatrixbrowser快速启动
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	datarepresentation，，，，基础设施，，，，软件
版本	1.0.1
在生物导体中	Bioc 3.12（R-4.0）（0.5岁）
执照	艺术2.0
要看	r（> = 4.0.0），砧
进口	Biocfilecache，，，，消化，，，，dplyr，，，，httr，，，，jsonlite，，，，矩阵， 方法，进步，，，，rlang，，，，Singlecellexperiment，统计，utils
链接
建议	生物使用，，，，尼特，，，，hcabrowser，，，，loomexpermiment（> = 1.5.3），readr
系统要求
增强
URL
BugReports	https://github.com/bioconductor/hcamatrixbrowser
取决于我
进口我	HCAEXPLORER，，，，Singlecellmultimodal
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	hcamatrixbrowser_1.0.1.tar.gz
Windows二进制	hcamatrixbrowser_1.0.1.zip
MacOS 10.13（高山脉）	hcamatrixbrowser_1.0.1.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hcamatrixbrowser
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/hcamatrixbrowser
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/hcamatrixbrowser/
软件包下载报告	下载统计