该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅Helloranges。
生物导体版本:3.12
将BedTools命令行调用转换为R代码调用来自生物导体 *范围的基础架构。这旨在教育新手生物导体使用者,并比较两个框架的语法和语义。
作者:迈克尔·劳伦斯
维护者:迈克尔·劳伦斯(Michael Lawrence)
引用(从r内,输入引用(“ Helloranges”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ helloranges”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Helloranges”)
R脚本 | Helloranges教程 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 注解,,,,覆盖范围,,,,DataImport,,,,基因数,,,,测序,,,,测序,,,,软件,,,,变体 |
版本 | 1.16.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.4(R-3.3)(4。5年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | 方法,生物基因,,,,S4VECTORS(> = 0.17.39),iranges(> = 2.13.12),基因组机(> = 1.31.10),生物弦(> = 2.41.3),BSGENOME,,,,GenomicFeatures(> = 1.31.5),变体(> = 1.19.3),rsamtools,,,,基因组签名(> = 1.15.7),rtracklayer(> = 1.33.8),GenomeInfodB,,,,总结性特征 |
进口 | docopt,统计,工具,utils |
链接 | |
建议 | Hellorangesdata,,,,生物使用 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | OMICSPCA |
建议我 | plyranges |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Helloranges_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | helloranges_1.16.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | Helloranges_1.16.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/helloranges |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/helloranges |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/helloranges/ |
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