Helloranges

doi:10.18129/b9.bioc.helloranges

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅Helloranges

向BedTools用户介绍 *范围

生物导体版本:3.12

将BedTools命令行调用转换为R代码调用来自生物导体 *范围的基础架构。这旨在教育新手生物导体使用者,并比较两个框架的语法和语义。

作者:迈克尔·劳伦斯

维护者:迈克尔·劳伦斯(Michael Lawrence)

引用(从r内,输入引用(“ Helloranges”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ helloranges”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Helloranges”)

PDF R脚本 Helloranges教程
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 注解,,,,覆盖范围,,,,DataImport,,,,基因数,,,,测序,,,,测序,,,,软件,,,,变体
版本 1.16.0
在生物导体中 Bioc 3.4(R-3.3)(4。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 方法,生物基因,,,,S4VECTORS(> = 0.17.39),iranges(> = 2.13.12),基因组机(> = 1.31.10),生物弦(> = 2.41.3),BSGENOME,,,,GenomicFeatures(> = 1.31.5),变体(> = 1.19.3),rsamtools,,,,基因组签名(> = 1.15.7),rtracklayer(> = 1.33.8),GenomeInfodB,,,,总结性特征
进口 docopt,统计,工具,utils
链接
建议 Hellorangesdata,,,,生物使用
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我 OMICSPCA
建议我 plyranges
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Helloranges_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 helloranges_1.16.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) Helloranges_1.16.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/helloranges
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/helloranges
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/helloranges/
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