打ic

doi：10.18129/b9.bioc.hicbricks

该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅打ic。

通过HDF文件存储和访问HI-C数据的框架

生物导体版本：3.12

Hicbricks是一个旨在处理大型高分辨率HI-C数据集的库。多年来，HI-C领域的数据集规模和复杂性迅速增加。hicbricks旨在克服与R环境中对此类大数据集的分析相关的挑战。Hicbricks提供了用户友好和高效的解决方案，用于处理大型高分辨率HI-C数据集。该软件包提供了一个带有砖块的R/生物导体框架，以构建更复杂的数据分析管道和算法。打脚已经结合了用于调用域边界和功能的示例算法，用于高质量数据可视化。

作者：Koustav Pal [AUT，CRE]，Carmen Livi [CTB]，Ilario Tagliaferri [CTB]

维护者：koustav pal

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ hicbricks”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ hicbricks”）

html	R脚本	简介Tohicbricks.html
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	DataImport，，，，嗝，，，，基础设施，，，，测序，，，，软件，，，，技术
版本	1.8.0
在生物导体中	Bioc 3.8（R-3.5）（2。5年）
执照	麻省理工学院 +文件执照
要看	r（> = 3.6），utils，卷曲，，，，RHDF5，，，，R6， 网格
进口	GGPLOT2，，，，维里迪斯，，，，rcolorbrewer，，，，秤，，，，RESHAPE2，，，，Stringr，，，，Data.Table，，，，GenomeInfodB，，，，基因组机，统计iranges，grdevices，S4VECTORS，，，，消化，，，，蒂布尔，，，，jsonlite，，，，生物比较，，，，r.utils，，，，readr， 方法
链接
建议	生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	hicbricks_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	hicbricks_1.8.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	hicbricks_1.8.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hicbricks
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/hicbricks
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/hicbricks/
软件包下载报告	下载统计