IWTomics

DOI:10.18129 / B9.bioc.IWTomics

该软件包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见IWTomics

组学数据的间隔检测

Bioconductor版本:3.12

组学数据的间隔测试(IWT)实现。这种推断程序测试两组基因组区域之间(或一组基因组区域与对称参考中心之间)“组学”数据的差异,并且不需要在开始时固定位置和规模。

作者:Marzia A Cremona, Alessia Pini, Francesca Chiaromonte, Simone Vantini

维护者:Marzia A Cremona

引用(来自R,输入引用(“IWTomics”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本"4.0")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("IWTomics")

对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

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browseVignettes(“IWTomics”)

PDF R脚本 IWTomics简介
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataImportDifferentialExpressionDifferentialMethylationDifferentialPeakCallingGenomeAnnotationMultipleComparison软件StatisticalMethod
版本 1.14.0
在Bioconductor中 BioC 3.5 (R-3.4)(4年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 GenomicRanges
进口 平行,gtable、网格、图形、方法IRangesKernSmooth食品及药物管理局S4Vectors, grDevices, stats, utils, tools
链接
建议 knitr
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

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源包 IWTomics_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 IWTomics_1.14.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) IWTomics_1.14.0.tgz
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/IWTomics
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/IWTomics
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/IWTomics/
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