keggprofile

doi:10.18129/b9.bioc.keggprofile

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅keggprofile

多类型和多组表达数据的注释和可视化软件包中的KEGG途径数据

生物导体版本:3.12

Keggprofile是一种注释和可视化工具,它在KEGG途径映射中集成了表达曲线和函数注释。多类型和多组表达数据可以在一个途径图中可视化。Keggprofile促进了有关特定功能的更详细的分析,改变了不同基因和样品中的内部途径或时间相关性。

作者:Shilin Zhao,Yan Guo,Yu Shyr

维护者:shilin zhao

引用(从r内,输入引用(“ keggprofile”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ keggprofile”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Keggprofile”)

PDF R脚本 keggprofile:申请示例
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 kegg,,,,途径,,,,软件
版本 1.32.0
在生物导体中 Bioc 2.11(R-2.15)(8。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看
进口 AnnotationDbi,,,,PNG,,,,Deachertimos,,,,XML,,,,kegg.db,,,,keggrest,,,,Biomart,,,,rcurl,,,,GGPLOT2,,,,RESHAPE2
链接
建议
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我 Intramirexplorer
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 keggprofile_1.32.0.tar.gz
Windows二进制 keggprofile_1.32.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) keggprofile_1.32.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/keggprofile
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/keggprofile
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/keggprofile/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题: