该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅keggprofile。
生物导体版本:3.12
Keggprofile是一种注释和可视化工具,它在KEGG途径映射中集成了表达曲线和函数注释。多类型和多组表达数据可以在一个途径图中可视化。Keggprofile促进了有关特定功能的更详细的分析,改变了不同基因和样品中的内部途径或时间相关性。
作者:Shilin Zhao,Yan Guo,Yu Shyr
维护者:shilin zhao
引用(从r内,输入引用(“ keggprofile”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ keggprofile”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Keggprofile”)
R脚本 | keggprofile:申请示例 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | kegg,,,,途径,,,,软件 |
版本 | 1.32.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.11(R-2.15)(8。5年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | |
进口 | AnnotationDbi,,,,PNG,,,,Deachertimos,,,,XML,,,,kegg.db,,,,keggrest,,,,Biomart,,,,rcurl,,,,GGPLOT2,,,,RESHAPE2 |
链接 | |
建议 | |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | Intramirexplorer |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | keggprofile_1.32.0.tar.gz |
Windows二进制 | keggprofile_1.32.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | keggprofile_1.32.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/keggprofile |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/keggprofile |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/keggprofile/ |
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