萝拉

DOI:10.18129 / B9.bioc.LOLA

此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见萝拉．

基因座重叠分析富集基因组范围

Bioconductor版本:3.12

提供功能，以测试基因组区域集与公共和自定义区域集(基因组范围)数据库的重叠。这使得对基因组区域集进行自动化富集分析成为可能，从而促进了功能基因组学和表观基因组学数据的解释。

作者:Nathan Sheffield [aut, cre]， Christoph Bock [ctb]

维护人员:Nathan Sheffield < Nathan at code.databio.org>

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“洛拉”)

超文本标记语言	R脚本	1.与洛拉开始
超文本标记语言	R脚本	2.使用洛拉核心
超文本标记语言	R脚本	3.选择一个宇宙
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeq，FunctionalGenomics，GeneRegulation，GeneSetEnrichment，GenomeAnnotation，MethylSeq，测序，软件，SystemsBiology
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 3.2 (R-3.2)(5.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 2.10)
进口	BiocGenerics，S4Vectors，IRanges，GenomicRanges，data.table，reshape2， utils, stats，方法
链接
建议	平行,testthat，knitr，BiocStyle，rmarkdown
SystemRequirements
增强了	simpleCache，qvalue，ggplot2
URL	http://code.databio.org/LOLA
BugReports	http://github.com/nsheff/LOLA
取决于我
进口我
建议我	可可，位深蓝，米拉
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	LOLA_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	LOLA_1.20.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	LOLA_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/LOLA
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/洛拉
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/LOLA/
包下载报告	下载数据