此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见LoomExperiment.
Bioconductor版本:3.12
LoomExperiment类提供了一种方法,可以轻松地将Bioconductor的“实验”类转换为loom文件,反之亦然。
作者:马丁·摩根,丹尼尔·范·特维斯克
维护者:Bioconductor包维护者< Bioconductor .org>的维护者
引用(从R中,输入引用(“LoomExperiment”)
):
要安装此包,启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“LoomExperiment”)
超文本标记语言 | R脚本 | 织机实验课的介绍 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataImport,DataRepresentation,ImmunoOncology,基础设施,SingleCell,软件 |
版本 | 1.8.0 |
在Bioconductor公司 | BioC 3.8 (R-3.5)(2.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.5.0),S4Vectors,SingleCellExperiment,SummarizedExperiment、方法、rhdf5,rtracklayer |
进口 | DelayedArray,GenomicRanges,HDF5Array,矩阵统计数据,stringr,跑龙套 |
链接 | |
建议 | testthat,BiocStyle,knitr,网状 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | HCAExplorer |
建议我 | HCAMatrixBrowser |
给我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | LoomExperiment_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | LoomExperiment_1.8.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | LoomExperiment_1.8.0.tgz |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/LoomExperiment |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/LoomExperiment |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/LoomExperiment/ |
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