桅杆

doi：10.18129/b9.bioc.mast

该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅桅杆。

基于模型的单细胞转录组学分析

生物导体版本：3.12

处理零充气的单细胞测定数据的方法和模型。

作者：Andrew McDavid [AUT，CRE]，Greg Finak [aut]，Masanao Yajima [aut]

维护者：Andrew McDavid

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ mast”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“桅杆”）

html	R脚本	桅杆介绍
html	R脚本	桅杆和单圈衍生包装之间的互距性
html	R脚本	使用桅杆进行过滤，差异表达和基因集富集在Mait细胞中
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	差异性，，，，基因表达，，，，基因烯，，，，rnaseq，，，，Singlecell，，，，软件，，，，转录组学
版本	1.16.0
在生物导体中	Bioc 3.4（R-3.3）（4。5年）
执照	GPL（> = 2）
要看	Singlecellexperiment（> = 1.2.0），R（> = 3.5）
进口	生物酶，，，，生物基因，，，，S4VECTORS，，，，Data.Table，，，，GGPLOT2，，，，plyr，，，，Stringr，，，，艾宾，方法，并行，RESHAPE2，Stats，stats4，图形，utils，总结性特征（> = 1.5.3），进步
链接
建议	尼特，，，，rmarkDown，，，，测试，，，，LME4（> = 1.0），BLME，，，，roxygen2（> 6.0.0），numderiv，，，，车，，，，gdata，，，，格子，，，，ggally，，，，gseabase，，，，NMF，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，RSVD，，，，林玛，，，，rcolorbrewer，，，，生物使用，，，，评分，，，，延迟，，，，矩阵，，，，HDF5Array，，，，Zinbwave，，，，dplyr
系统要求
增强
URL	https://github.com/rglab/mast/
BugReports	https://github.com/rglab/mast/issues
取决于我
进口我	Celaref，，，，塞尔达，，，，Singlecelltk
建议我	簇发酵
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	mast_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	mast_1.16.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	mast_1.16.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mast
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/桅杆
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/mast/
软件包下载报告	下载统计