MSstats

DOI:10.18129 / B9.bioc.MSstats

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见MSstats．

无标签或基于标签的蛋白质组学实验中DDA、SRM和DIA的蛋白质显著性分析

Bioconductor版本:3.12

一套用于DDA、SRM和DIA实验中统计相对蛋白显著性分析的工具。

作者:Meena Choi [aut, cre]，蔡宗恒[aut]， Cyril Galitzine [aut]， Ting Huang [aut]， Olga Vitek [aut]

维护者:Meena Choi

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("MSstats")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“MSstats”)

超文本标记语言	R脚本	MSstats:蛋白质/肽显著性分析
PDF		参考手册

细节

biocViews	ImmunoOncology，MassSpectrometry，归一化，蛋白质组学，质量控制，软件，TimeCourse
版本	3.22.1
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(7.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.6)
进口	lme4，marray，limma，gplots，ggplot2，方法，网格，ggrepel，preprocessCore，reshape2，生存，statmod，minpack.lm， utils, grDevices，图形，统计，doSNOW，雪，foreach，data.table，质量，dplyr，tidyr，扫帚，purrr，stringr
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，MSstatsBioData
SystemRequirements
增强了
URL	http://msstats.org
BugReports	https://groups.google.com/forum/ !论坛/ msstats
全靠我
进口我	artMS，MSstatsSampleSize，MSstatsTMT
建议我	MSstatsBioData，MSstatsTMTPTM
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	MSstats_3.22.1.tar.gz
Windows二进制	MSstats_3.22.1.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	MSstats_3.22.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MSstats
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MSstats
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/MSstats/
软件包下载报告	下载数据