此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见OVESEG.
Bioconductor版本:3.12
用于多组比较的R包,以检测亚型之间的组织/细胞特异性标记基因。它提供了计算OVESEG-test统计数据的函数,在混合零分布模型中推导组件权重,并从加权聚合排列中估计p值。得到的成分零假设的后验概率也可以刻画子类型间的各种上调模式。
作者:陈璐璐
维护人员:Lulu Chen
引文(从R内,输入引用(“OVESEG”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("OVESEG")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“OVESEG”)
超文本标记语言 | R脚本 | OVESEG用户手册 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | CellBiology,GeneExpression,MultipleComparison,软件 |
版本 | 1.6.0 |
在Bioconductor | BioC 3.9 (R-3.6)(2年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (>= 3.6) |
进口 | 统计,效用,方法,BiocParallel,SummarizedExperiment,limma,fdrtool,Rcpp |
链接 | Rcpp |
建议 | knitr,rmarkdown,BiocStyle,testthat,ggplot2,gridExtra、网格reshape2,尺度 |
SystemRequirements | c++ 11 |
增强了 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/Lululuella/OVESEG |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | OVESEG_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | OVESEG_1.6.0.zip(32位和64位) |
macOS 10.13 (High Sierra) | OVESEG_1.6.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/OVESEG |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/OVESEG |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/OVESEG/ |
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