PAA

DOI:10.18129 / B9.bioc.PAA

此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见PAA．

蛋白质阵列分析仪

Bioconductor版本:3.12

PAA导入以gpr文件格式保存的单色(蛋白质)微阵列数据，特别是ProtoArray数据。在预处理(背景校正、批量过滤、归一化)后进行单变量特征预选(例如，使用“最小M统计量”方法——以下简称“mm”)。随后，进行多变量特征选择，以发现生物标志物候选。因此，既可以采用基于频率的反向消除方法，也可以采用集成特征选择。PAA提供了一个完整的分析工具工具箱，包括用于结果检查和评估的几个不同的图。

作者:Michael Turewicz [aut, cre]， Martin Eisenacher [ctb, cre]

维护者:Michael Turewicz < Michael。turewicz at rub.de>， Martin Eisenacher < Martin。在rub.de eisenach >

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes (PAA)

PDF	R脚本	PAA教程
PDF		PAA_1.7.1.pdf
PDF		参考手册
文本		自述
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	分类，微阵列，OneChannel，蛋白质组学，软件
版本	1.24.0
Bioconductor自	bio 3.0 (R-3.1)(6.5年)
许可证	BSD_3_clause +文件许可证
取决于	R (> = 3.2.0),Rcpp(> = 0.11.6)
进口	e1071，gplots，gtools，limma，质量mRMRe,randomForest，ROCR，股东价值分析
链接	Rcpp
建议	BiocStyle，RUnit，BiocGenerics，vsn
SystemRequirements	c++软件包随机丛林
增强了
URL	http://www.ruhr-uni-bochum.de/mpc/software/PAA/
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	PAA_1.24.0.tar.gz
Windows二进制	PAA_1.24.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	PAA_1.24.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PAA
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ PAA
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/PAA/
包下载报告	下载数据