POMA

DOI:10.18129 / B9.bioc.POMA

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见POMA

质谱数据预处理和统计分析的用户友好的工作流程

Bioconductor版本:3.12

POMA为质谱数据的可视化、预处理、探索性和统计分析引入了结构化、可重复和易于使用的工作流程。POMA的主要目的是在一个易于理解和用户友好的R包中实现灵活的数据清理和统计分析过程。这个包也有一个闪亮的应用程序版本,实现所有的POMA功能。见https://github.com/pcastellanoescuder/POMAShiny。

作者:Pol Castellano-Escuder [aut, cre], Raúl González-Domínguez [aut],克里斯蒂娜Andrés-Lacueva [aut], Alex Sánchez-Pla [aut]

维护者:Pol Castellano-Escuder

引文(从R内,输入引用(“POMA”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("POMA")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“POMA”)

超文本标记语言 R脚本 POMA EDA示例
超文本标记语言 R脚本 POMA归一化方法
超文本标记语言 R脚本 POMA工作流
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews MassSpectrometry代谢组学归一化预处理蛋白质组学ReportWriting软件可视化
版本 1.0.0
在Bioconductor BioC 3.12 (R-4.0)(0.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 4.0)
进口 Biobase扫帚脱字符号clisymbolsComplexHeatmap蜡笔dplyre1071ggcorrplotggplot2ggraphggrepelglasso(> = 1.11),glmnet嫁祸于knitrlimmamagrittrmixOmicsMSnbase(> = 2.12),拼接而成情节qpdfrandomForestRankProd(> = 3.14),reshape2rmarkdown宠物猫tidyr素食主义者
链接
建议 BiocStylecovrtidyversetestthat2.3.2 (> =)
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/pcastellanoescuder/POMA
BugReports https://github.com/pcastellanoescuder/POMA/issues
全靠我
进口我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 POMA_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 POMA_1.0.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) POMA_1.0.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/POMA
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/POMA
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/POMA/
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