此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见RDAVIDWebService.
Bioconductor版本:3.12
从数据库中检索用于注释、可视化和集成发现(DAVID)的工具,使用Web服务将数据检索到R对象中。该软件包提供了DAVID网站的主要功能,包括:i)用户友好连接上传基因/背景列表,更改基因/背景位置,选择当前物种/s,选择注释等ii)提交的基因列表报告,注释类别摘要,基因/术语聚类,功能注释图,功能注释表
作者:克里斯托巴尔·弗雷斯诺和埃尔默·a·费尔南德斯
维护者:Cristobal Fresno
引用(从R中,输入引用(“RDAVIDWebService”)
):
要安装此包,启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“RDAVIDWebService”)
R脚本 | RDAVIDWebService:一个面向DAVID的多功能R接口 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DifferentialExpression,GraphAndNetwork,软件,可视化 |
版本 | 1.28.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.13 (R-3.0)(7.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R(>= 2.14.1),方法,图,GOstats,ggplot2 |
进口 | 类别,GO.db,RBGL,rJava |
链接 | |
建议 | Rgraphviz |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://www.bdmg.com.arhttp://david.abcc.ncifcrf.gov/ |
取决于我 | CompGO |
进口我 | |
建议我 | FGNet,IntramiRExploreR |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | RDAVIDWebService_1.28.0.tar.gz |
Windows二进制 | RDAVIDWebService_1.28.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | RDAVIDWebService_1.28.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RDAVIDWebService |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RDAVIDWebService |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/RDAVIDWebService/ |
包下载报告 | 下载数据 |
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Bioconductor
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