RDAVIDWebService

DOI:10.18129 / B9.bioc.RDAVIDWebService

此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见RDAVIDWebService

一个R包,用于使用Web服务API从DAVID检索数据到R对象。

Bioconductor版本:3.12

从数据库中检索用于注释、可视化和集成发现(DAVID)的工具,使用Web服务将数据检索到R对象中。该软件包提供了DAVID网站的主要功能,包括:i)用户友好连接上传基因/背景列表,更改基因/背景位置,选择当前物种/s,选择注释等ii)提交的基因列表报告,注释类别摘要,基因/术语聚类,功能注释图,功能注释表

作者:克里斯托巴尔·弗雷斯诺和埃尔默·a·费尔南德斯

维护者:Cristobal Fresno

引用(从R中,输入引用(“RDAVIDWebService”)):

安装

要安装此包,启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“RDAVIDWebService”)

PDF R脚本 RDAVIDWebService:一个面向DAVID的多功能R接口
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DifferentialExpressionGraphAndNetwork软件可视化
版本 1.28.0
Bioconductor自 BioC 2.13 (R-3.0)(7.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R(>= 2.14.1),方法,GOstatsggplot2
进口 类别GO.dbRBGLrJava
链接
建议 Rgraphviz
SystemRequirements
增强了
URL http://www.bdmg.com.arhttp://david.abcc.ncifcrf.gov/
取决于我 CompGO
进口我
建议我 FGNetIntramiRExploreR
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 RDAVIDWebService_1.28.0.tar.gz
Windows二进制 RDAVIDWebService_1.28.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) RDAVIDWebService_1.28.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RDAVIDWebService
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RDAVIDWebService
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/RDAVIDWebService/
包下载报告 下载数据

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