RNAprobR

DOI:10.18129 / B9.bioc.RNAprobR

此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见RNAprobR．

一个R包，用于分析基于大量并行测序的RNA结构探测数据

Bioconductor版本:3.12

该软件包便于分析下一代测序数据，其中具有单核苷酸分辨率的位置信息是关键。它允许在表或UCSC兼容的床图文件中应用不同类型的相关规范化、数据可视化和导出。

作者:Lukasz Jan Kielpinski [aut]， Nikos Sidiropoulos [cre, aut]， Jeppe Vinther [aut]

维护者:Nikos Sidiropoulos < Nikos。在gmail.com sidiro >

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“RNAprobR”)

PDF	R脚本	RNAprobR:一个R包，用于分析大量基于并行测序的RNA结构探测方法
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	报道，GenomeAnnotation，归一化，测序，软件
版本	1.22.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (R-3.2)(6年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.1.1),GenomicFeatures(> = 1.16.3),plyr(> = 1.8.1),BiocGenerics(> = 0.10.0)
进口	Biostrings(> = 2.32.1),GenomicRanges(> = 1.16.4),IRanges(> = 2.10.5),Rsamtools(> = 1.16.1),rtracklayer(> = 1.24.2),GenomicAlignments(> = 1.5.12),S4Vectors(>= 0.14.7)，图形，统计，utils
链接
建议	BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	RNAprobR_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	RNAprobR_1.22.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	RNAprobR_1.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RNAprobR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RNAprobR
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/RNAprobR/
包下载报告	下载数据