SRGnet

DOI:10.18129 / B9.bioc.SRGnet

该软件包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见SRGnet。

SRGnet:一个基于转录组学数据研究基因突变协同反应的R包

Bioconductor版本:3.12

我们开发SRGnet来分析转录组谱中的协同调节机制，这些机制可以增强细胞对突变、药物或环境暴露组合的整体反应。该软件包可用于识别协同反应基因下游的调控模块，优先考虑可能成为潜在干预目标的协同调控基因，并将基因扰动实验置于背景下。

作者:Isar Nassiri [aut, cre]， Matthew McCall [aut, cre]

维护者:Isar Nassiri

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.0")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("SRGnet")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“SRGnet”)

超文本标记语言		SRGnet一个基于转录组学数据研究基因突变协同响应的R包
PDF		参考手册

细节

biocViews	回归，软件，StatisticalMethod
版本	1.16.0
在Bioconductor中	BioC 3.4 (R-3.3)(4.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.3.1)，EBcoexpress，质量，igraph，pvclust(2.0 > = 0),“绿带运动”(> = 2.1.1),limma， DMwR (>= 0.4.1);matrixStats，Hmisc
进口
链接
建议	knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	SRGnet_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	SRGnet_1.16.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	SRGnet_1.16.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/SRGnet
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/SRGnet
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/SRGnet/
软件包下载报告	下载数据