SVAPLSseq

DOI:10.18129 / B9.bioc.SVAPLSseq

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此包适用于Bioconductor 3.12版。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定发布版本，请参见SVAPLSseq．

svaplsseq -一个R包，用于估计隐藏的不需要的可变性因素，并对其进行调整，以实现基于RNAseq数据的更强大和准确的差分表达式分析

Bioconductor版本:3.12

该软件包包含用于提取RNAseq数据中潜在变异的签名的函数，并使用它们对两个指定生物组之间的一组特征(基因，转录本)执行改进的差异表达分析。

作者:Sutirtha Chakraborty

维护者:Sutirtha Chakraborty

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("SVAPLSseq")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	BatchEffect，GeneExpression，ImmunoOncology，归一化，RNASeq，软件
版本	1.16.0
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(4.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.4)
进口	方法、统计数据SummarizedExperiment，刨边机，ggplot2，limma，航空航天平行,请
链接
建议	BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SVAPLSseq
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SVAPLSseq
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/SVAPLSseq/
软件包下载报告	下载数据