SimFFPE

DOI:10.18129 / B9.bioc.SimFFPE

此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见SimFFPE．

用于FFPE组织的NGS读取模拟器

Bioconductor版本:3.12

该软件包模拟了福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织的下一代测序(NGS)过程中专门生成的伪影嵌合reads。

作者:韦兰英

维护者:Lanying Wei < Lanying。Wei在uni-muenster.de>

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("SimFFPE")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“SimFFPE”)

PDF	R脚本	SimFFPE的介绍
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	对齐，DataImport，MultipleComparison，SequenceMatching，测序，软件
版本	1.2.0
在Bioconductor公司	BioC 3.11 (R-4.0)(1年)
许可证	LGPL-3
取决于	Biostrings
进口	dplyr，foreach，doParallel，truncnorm，GenomicRanges，IRanges，Rsamtools，并行，图形，统计，工具，方法
链接
建议	BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
给我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	SimFFPE_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	SimFFPE_1.2.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	SimFFPE_1.2.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/SimFFPE
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SimFFPE
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/SimFFPE/
软件包下载报告	下载数据