该软件包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见彩带.
Bioconductor版本:3.12
在R中处理大型数据文件可能很困难,因为数据通常驻留在内存中。这个包鼓励一种编程风格,其中数据通过“生产者”和一系列“消费者”从磁盘“流”到R,通常会将原始数据减少到可管理的大小。该包为数据输入、采样、索引和转换等操作提供了有用的生产者和消费者流组件;看到包吗?彩带for details.
作者:Martin Morgan, Nishant Gopalakrishnan
维护者:Martin Morgan < Martin。摩根在roswellpark.org>
引用(来自R,输入引用(“流光”)
):
要安装这个包,启动R(版本"4.0")并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("Streamer")
对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:
browseVignettes(“流光”)
R脚本 | Streamer:一个简单的例子 | |
参考手册 |
biocViews | DataImport,基础设施,软件 |
版本 | 1.36.0 |
在Bioconductor中 | BioC 2.9 (R-2.14)(9.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | |
进口 | 方法,图,RBGL平行,BiocGenerics |
链接 | |
建议 | RUnit,Rsamtools(> = 1.5.53),GenomicAlignments,Rgraphviz |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
这取决于我 | |
进口我 | plethy |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。
源包 | Streamer_1.36.0.tar.gz |
Windows二进制 | Streamer_1.36.0.zip(32- & 64位) |
macOS 10.13 (High Sierra) | Streamer_1.36.0.tgz |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/Streamer |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/Streamer |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/Streamer/ |
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