结构线

doi：10.18129/b9.bioc.structstrings

该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅结构线。

使用生物弦的DOT支架注释的实施

生物导体版本：3.12

结构包装实现了广泛使用的点支架注释，用于将基本配对信息存储在结构化RNA中。structStrings使用BioStrings软件包提供的基础架构，并从BSTRING类中得出DotbracketString和相关类。从这些过程中，可以在深度分析中产生基对表。另外，也可以检索基础对的循环指数。为了提高效率，在C中实现了信息转换，并受到Viennarna软件包的启发。

作者：Felix G.M.恩斯特[aut，cre]

维护者：Felix G.M.ernst

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ structStrings”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“结构线”）

html	R脚本	结构线
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	结盟，，，，DataImport，，，，datarepresentation，，，，基础设施，，，，测序，，，，测序，，，，软件
版本	1.6.1
在生物导体中	Bioc 3.9（R-3.6）（2年）
执照	艺术2.0
要看	r（> = 4.0），S4VECTORS（> = 0.27.12），iranges（> = 2.23.9），生物弦（> = 2.57.2）
进口	方法，生物基因，，，，xvector，，，，Stringr，，，，Stringi，，，，蜡笔，grdevices
链接	iranges，，，，S4VECTORS
建议	测试，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，Trnascanimport，，，，生物使用
系统要求
增强
URL	https://github.com/felixernst/structstrings
BugReports	https://github.com/felixernst/structstrings/issues
取决于我	tRNA，，，，Trnadbimport
进口我	Trnascanimport
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	structStrings_1.6.1.tar.gz
Windows二进制	structStrings_1.6.1.zip（32-和64位）
MacOS 10.13（高山脉）	structStrings_1.6.1.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/structstrings
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/结构线
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/Structstrings/
软件包下载报告	下载统计