tfea.chip

doi：10.18129/b9.bioc.tfea.chip

该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅tfea.chip。

分析转录因子富集

生物导体版本：3.12

使用CHIP-Seq实验的数据在基因集中分析转录因子富集的包装。

作者：Laura PuenteSantamaría，Luis del Peso

维护者：laura puentesantamaría

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ tfea.chip”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ tfea.chip”）

html	R脚本	TFEA.CHIP：用于转录因子富集的工具套件
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	chipseq，，，，结肠管制，，，，基因烯，，，，免疫学，，，，rnaseq，，，，测序，，，，软件，，，，转录，，，，转录组学
版本	1.10.0
在生物导体中	Bioc 3.7（R-3.5）（3年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 3.3）
进口	基因组机，，，，iranges，，，，Biomart，，，，GenomicFeatures，grdevices，dplyr，统计，utils，r.utils， 方法，org.hs.eg.db
链接
建议	尼特，，，，rmarkDown，，，，S4VECTORS，，，，情节，，，，秤，，，，花花公子，，，，GGPLOT2，，，，gseabase，，，，deseq2，，，，生物基因，，，，Ggrepel，，，，rcompanion，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	tfea.chip_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	tfea.chip_1.10.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	tfea.chip_1.10.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tfea.chip
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/tfea.chip
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/tfea.chip/
软件包下载报告	下载统计