TMixClust

DOI:10.18129 / B9.bioc.TMixClust

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见TMixClust

基于高斯混合效应模型和平滑样条的基因表达时间序列聚类

Bioconductor版本:3.12

基于高斯变量混合效应模型和非参数三次样条估计的时间序列基因表达数据聚类方法的实现。该方法可以可靠地解释在典型的基因表达时间序列数据集中存在的高水平噪声。

作者:Monica Golumbeanu < Golumbeanu。莫妮卡在gmail.com>

维护者:Monica Golumbeanu < Golumbeanu。莫妮卡在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“TMixClust”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("TMixClust")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“TMixClust”)

PDF R脚本 时间序列基因表达数据的TMixClust聚类
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 聚类GeneExpression软件StatisticalMethodTimeCourse
版本 1.12.0
在Bioconductor BioC 3.6 (R-3.4)(3.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R (>= 3.4)
进口 gssmvtnorm统计数据,动物园集群跑龙套,BiocParallelflexclust, grDevices,图形,BiobaseSPEM
链接
建议 rmarkdownknitrBiocStyletestthat
SystemRequirements
增强了
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 TMixClust_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 TMixClust_1.12.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) TMixClust_1.12.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TMixClust
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TMixClust
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/TMixClust/
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