TimeSeriesExperiment

DOI:10.18129 / B9.bioc.TimeSeriesExperiment

此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见TimeSeriesExperiment．

短时间序列数据分析

Bioconductor版本:3.12

针对短期课程数据的可视化和分析工具箱，包括降维、聚类、双样本差异表达检测和基因排序技术。该软件包还提供了检索富集路径的方法。

作者:阮兰香

维护人员:Lan Huong Nguyen

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("TimeSeriesExperiment")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“TimeSeriesExperiment”)

超文本标记语言	R脚本	基因表达时间过程数据分析
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	聚类，DifferentialExpression，GeneExpression，ImmunoOncology，微生物组，归一化，通路，PrincipalComponent，RNASeq，测序，软件，TimeCourse，转录，可视化
版本	1.8.0
在Bioconductor公司	BioC 3.8 (R-3.5)(2.5年)
许可证	LGPL (>= 3)
取决于	R (>= 3.5.0)，S4Vectors(> = 0.19.23),SummarizedExperiment(> = 1.11.6)
进口	dynamicTreeCut，dplyr，刨边机，DESeq2，ggplot2(>= 3.0.0)，图形，Hmisc，limma、方法、magrittr，代理统计数据,宠物猫，tidyr，素食主义者，冬青,跑龙套
链接
建议	Biobase，BiocFileCache(> = 1.5.8),circlize，ComplexHeatmap，GO.db， grDevices，网格，knitr，org.Mm.eg.db，org.Hs.eg.db，质量，RColorBrewer，rmarkdown，UpSetR
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/nlhuong/TimeSeriesExperiment
BugReports	https://github.com/nlhuong/TimeSeriesExperiment/issues
全靠我
进口我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	TimeSeriesExperiment_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	TimeSeriesExperiment_1.8.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	TimeSeriesExperiment_1.8.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/TimeSeriesExperiment
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TimeSeriesExperiment
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/TimeSeriesExperiment/
软件包下载报告	下载数据