TransView

DOI:10.18129 / B9.bioc.TransView

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见TransView

读取密度图的构建和接入。ChIPSeq和RNASeq数据集的可视化

Bioconductor版本:3.12

该软件包提供了有效的工具来生成、访问和显示基于测序的数据集(如RNA-Seq和ChIP-Seq)的读密度。

作者:朱利叶斯·穆勒

维护者:Julius Muller

引文(从R内,输入引用(“TransView”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“TransView”)

PDF R脚本 TransView的介绍
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews ChIPSeq聚类DNAMethylationDataImportGeneExpressionImmunoOncologyMethylSeq微阵列MultipleComparisonRNASeq测序软件转录可视化
版本 1.34.0
在Bioconductor BioC 2.11 (R-2.15)(8.5年)
许可证 GPL-3
取决于 方法,GenomicRanges
进口 BiocGenericsS4Vectors(> = 0.9.25),IRangeszlibbiocgplots
链接 Rhtslib(> = 1.15.3)
建议 RUnitpasillaBamSubsetBiocManager
SystemRequirements GNU使
增强了
URL //www.andersvercelli.com/packages/release/bioc/html/TransView.html
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 TransView_1.34.0.tar.gz
Windows二进制 TransView_1.34.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra) TransView_1.34.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TransView
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TransView
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/TransView/
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