TxRegInfra

DOI:10.18129 / B9.bioc.TxRegInfra

这个包是弃用。它可能会从Bioconductor删除。请参考包临终的指导方针为更多的信息。

这个包是Bioconductor的3.12版本。这个包已经从Bioconductor删除。最后稳定,最新的发布版本,请参阅TxRegInfra。

元数据管理multiomic转录监管规范的网络

Bioconductor版本:3.12

这个包提供基因组元数据的接口,用于监管创建网络,重点是noSQL的解决方案。目前定量表征eQTLs, DnaseI过敏症网站和数字基因组组装的足迹RaggedExperiment API的使用扩展内存不足。

作者:文斯凯里

维修工:VJ凯里< stvjc channing.harvard.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“TxRegInfra”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“TxRegInfra”)

HTML	R脚本	垫片在TxRegInfra
HTML	R脚本	TxRegInfra——TxRegQuery类和方法
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	网络,软件
版本	1.10.0
Bioconductor自	BioC 3.7 (r - 3.5)(3年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5),RaggedExperiment(> = 1.3.11),mongolite
进口	方法,rjson,GenomicRanges,IRanges,BiocParallel,GenomeInfoDb,S4Vectors,SummarizedExperiment,跑龙套
链接
建议	knitr,GenomicFiles,EnsDb.Hsapiens.v75,testthat,闪亮的,biovizBase(> = 1.27.2),Gviz,AnnotationFilter,ensembldb,ontoProc,rjson,图,TFutils(> = 1.5.4)
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	TxRegInfra_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	TxRegInfra_1.10.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	TxRegInfra_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TxRegInfra
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ TxRegInfra
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/TxRegInfra/
包下载报告	下载数据