VaSP

DOI:10.18129 / B9.bioc.VaSP

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见VaSP．

群体剪接变异的量化与可视化

Bioconductor版本:3.12

从短读RNA-seq数据中发现全基因组可变的替代剪接事件，并将基因剪接信息可视化，用于人群中发表质量的多面板图。

作者:余辉辉[aut, cre]， Qian Du [aut]，张驰[aut]

维护者:Huihui Yu

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes (VaSP)

超文本标记语言	R脚本	用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AlternativeSplicing，聚类，DifferentialExpression，DifferentialSplicing，ImmunoOncology，KEGG，预处理，RNASeq，软件，StatisticalMethod，可视化
版本	1.2.5
在Bioconductor	BioC 3.12 (R-4.0)(0.5年)
许可证	GPL (>= 2.0)
取决于	R (>= 4.0)，舞会礼服
进口	IRanges，GenomicRanges，S4Vectors，寿司平行,matrixStats，GenomicAlignments，GenomeInfoDb，Rsamtools，集群，统计，图形，方法
链接
建议	knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/yuhuihui2011/VaSP
BugReports	https://github.com/yuhuihui2011/VaSP/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	VaSP_1.2.5.tar.gz
Windows二进制	VaSP_1.2.5.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	VaSP_1.2.5.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/VaSP
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/VaSP
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/VaSP/
软件包下载报告	下载数据