该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅vplotr。
生物导体版本:3.12
消化和保护DNA核酸酶的模式,例如DNase I,微球菌核酸酶和TN5转座酶可用于推断相关蛋白的位置。该软件包包含有用的功能来分析配对末端测序片段密度的模式。VPLOTR促进了对单个或聚集的基因组基因座的V-图和足迹轮廓的产生。
维护者:jacques serizay
引用(从r内,输入引用(“ vplotr”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ vplotr”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ vplotr”)
html | R脚本 | vplotr |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | Atacseq,,,,结盟,,,,生物问题,,,,覆盖范围,,,,核粉置换,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.0.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.12(R-4.0)(0.5岁) |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 4.0),基因组机,,,,iranges,,,,GGPLOT2 |
进口 | 牛仔图,,,,马格里特,,,,GenomeInfodB,,,,基因组签名,,,,rcolorbrewer,,,,动物园,,,,rsamtools,,,,S4VECTORS, 平行,RESHAPE2,方法,图形,统计 |
链接 | |
建议 | GenomicFeatures,,,,txdb.scerevisiae.ucsc.saccer3.sgdgene,,,,测试,,,,COVR,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,pkgdown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/js2264/vplotr |
BugReports | https://github.com/js2264/vplotr/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | vplotr_1.0.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | vplotr_1.0.0.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | vplotr_1.0.0.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/vplotr |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/vplotr |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/vplotr/ |
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