beachmat

DOI:10.18129 / B9.bioc.beachmat

此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见beachmat

编译Bioconductor以处理每种矩阵类型

Bioconductor版本:3.12

提供一致的c++类接口,用于从各种常用的矩阵类型中读取和写入数据。直接支持普通矩阵和几个稀疏/密集矩阵类,第三方S4类可以通过外部链接支持,而其他所有矩阵都通过DelayedArray块处理。

作者:Aaron Lun [aut, cre], Hervé Pagès [aut], Mike Smith [aut]

维护者:Aaron Lun 的键盘

引用(从R中,输入引用(“beachmat”)):

安装

要安装此包,启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("beachmat")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“beachmat”)

超文本标记语言 R脚本 1.开发人员指南
超文本标记语言 R脚本 2.用c++ (v2)从R矩阵中读取数据
超文本标记语言 R脚本 3.将数据写入R个矩阵对象(v2)
超文本标记语言 R脚本 4.支持任意矩阵类(v2)
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataImportDataRepresentation基础设施软件
版本 2.6.4
在Bioconductor公司 BioC 3.6 (R-3.4)(3.5年)
许可证 GPL-3
取决于
进口 方法,DelayedArray(> = 0.15.14),BiocGenerics矩阵
链接
建议 testthatBiocStyleknitrrmarkdownrcmdcheckBiocParallel
SystemRequirements c++ 11
增强了
URL
全靠我
进口我 BiocSingularDropletUtils食物天窗
建议我 bsseqglmGamPoimbkmeansPCAtoolsscCB2TSCAN
给我的链接 BiocSingularbsseqDropletUtilsglmGamPoimbkmeansPCAtools食物天窗
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 beachmat_2.6.4.tar.gz
Windows二进制 beachmat_2.6.4.zip
macOS 10.13 (High Sierra) beachmat_2.6.4.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/beachmat
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/beachmat
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/beachmat/
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