bigmelon

DOI:10.18129 / B9.bioc.bigmelon

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见bigmelon．

大型实验用Illumina甲基化阵列分析

Bioconductor版本:3.12

使用gdsfmt处理Illumina阵列的方法。

作者:Tyler J. Gorrie-Stone [cre, aut]， Ayden Saffari [aut]， Karim Malki [aut]， Leonard C. Schalkwyk [aut]

维护者:Tyler J. Gorrie-Stone < Tyler。Gorrie-stone在diamond.ac.uk>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("bigmelon")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“bigmelon”)

PDF	R脚本	大甜瓜包装
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CpGIsland，DNAMethylation，DataImport，MethylationArray，微阵列，预处理，质量控制，软件，TwoChannel
版本	1.16.0
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(4.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.3)，西瓜(> = 1.25.0),gdsfmt(>= 1.0.4)，方法minfi(> = 1.21.0),Biobase，methylumi
进口	属性,跑龙套,GEOquery、图形、BiocGenerics
链接
建议	BiocGenerics，RUnit，BiocStyle，minfiData平行,IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19，IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b2.hg19，bumphunter
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	bigmelon_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	bigmelon_1.16.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	bigmelon_1.16.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bigmelon
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/bigmelon
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/bigmelon/
软件包下载报告	下载数据