此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见bioCancer.
Bioconductor版本:3.12
bioCancer是一款可视化和交互式分析癌症基因组数据的多分析应用程序。
作者:Karim Mezhoud [aut, cre]
维护者:Karim Mezhoud
引文(从R内,输入引用(“bioCancer”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("bioCancer")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“bioCancer”)
超文本标记语言 | R脚本 | 生物癌症:交互式多组学癌症数据可视化和分析 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | DataRepresentation,GUI,GeneExpression,GeneTarget,MultipleComparison,网络,通路,Reactome,软件,可视化 |
版本 | 1.18.0 |
在Bioconductor | BioC 3.4 (R-3.3)(4.5年) |
许可证 | AGPL-3 |文件许可证 |
取决于 | R (>= 3.5.0),radiant.data(> = 1.0.6),cgdsr(> =)相对于1.2.6,XML(> = 3.99) |
进口 | 闪亮的(> = 1.0.5),AlgDesign(> = 1.1.7.3),进口(>= 1.1.0),方法shinythemes,Biobase,geNetClassifier,AnnotationFuncs,org.Hs.eg.db,剂量,clusterProfiler,reactome.db,ReactomePA,图(> = 1.0.5),visNetwork,htmlwidgets,plyr,宠物猫,DT(> = 0.12),dplyr(> = 0.8.5) |
链接 | |
建议 | BiocStyle,rmarkdown,knitr,testthat(> = 0.10.0) |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://kmezhoud.github.io/bioCancer |
BugReports | https://github.com/kmezhoud/bioCancer/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | bioCancer_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | bioCancer_1.18.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | bioCancer_1.18.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bioCancer |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/bioCancer |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/bioCancer/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
文档»
Bioconductor
支持»
请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一: