BSSEQ

doi：10.18129/b9.bioc.bsseq

该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅BSSEQ。

分析，管理和存储Bisulfite测序数据

生物导体版本：3.12

用于分析和可视化Bisulfite测序数据的工具集合。

作者：Kasper Daniel Hansen [AUT，CRE]，Peter Hickey [aut]

维护者：gmail.com上的Kasper Daniel Hansen

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ bsseq”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ BSSEQ”）

html	R脚本	用BSSEQ分析WGB数据
html	R脚本	BSSEQ用户指南
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	DNAMETHYLATY，，，，软件
版本	1.26.0
在生物导体中	Bioc 2.11（R-2.15）（8。5年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 4.0），方法，生物基因，，，，基因组机（> = 1.41.5），总结性特征（> = 1.19.5）
进口	iranges（> = 2.23.9），GenomeInfodB，，，，秤，统计，图形，生物酶，，，，Locfit，，，，gtools，，，，Data.Table（> = 1.11.8），S4VECTORS（> = 0.27.12），r.utils（> = 2.0.0），延迟的matrixstats（> = 1.5.2），输入，，，，林玛，，，，延迟（> = 0.15.16），RCPP，，，，生物比较，，，，BSGENOME，，，，生物弦，utils，HDF5Array（> = 1.15.19），RHDF5
链接	RCPP，，，，beachmat
建议	测试，，，，BSSEQDATA，，，，生物使用，，，，rmarkDown，，，，尼特，，，，矩阵，，，，多帕尔，，，，rtracklayer，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38，，，，beachmat（> = 1.5.2），batchjobs
系统要求	C ++ 11
增强
URL	https://github.com/kasperdanielhansen/bsseq
BugReports	https://github.com/kasperdanielhansen/bsseq/issues
取决于我	饼干，，，，BSSEQDATA，，，，DMRSEQ，，，，DSS
进口我	dmrcate，，，，Methcp，，，，甲基接受，，，，甲基化，，，，米拉，，，，纳米塞维兹，，，，Scmeth，，，，tcgawgbsdata.hg19
建议我	Methrix，，，，组织
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	bsseq_1.26.0.tar.gz
Windows二进制	bsseq_1.26.0.zip（32-和64位）
MacOS 10.13（高山脉）	BSSEQ_1.26.0.TGZ
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bsseq
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/bsseq
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/bsseq/
软件包下载报告	下载统计