bumphunter

DOI:10.18129 / B9.bioc.bumphunter

此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见bumphunter

撞猎人

Bioconductor版本:3.12

在基因组数据中发现凸起的工具

作者:Rafael A. Irizarry [cre, aut], Martin Aryee [aut], Kasper Daniel Hansen [aut], Hector Corrada Bravo [aut], Shan Andrews [ctb], Andrew E. Jaffe [ctb], Harris Jaffee [ctb], Leonardo Collado-Torres [ctb]

维护人:Rafael A. Irizarry

引用(从R中,输入引用(“bumphunter”)):

安装

要安装此包,启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“bumphunter”)

PDF R脚本 bumphunter用户指南
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DNAMethylation表观遗传学ImmunoOncology基础设施MultipleComparison软件
版本 1.32.0
Bioconductor自 BioC 2.12 (R-3.0)(8年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 3.5),S4Vectors(> = 0.9.25),IRanges(> = 2.3.23),GenomeInfoDbGenomicRangesforeach迭代器、方法、并行locfit
进口 matrixStatslimmadoRNGBiocGenerics跑龙套,GenomicFeaturesAnnotationDbi,统计数据
链接
建议 testthatRUnitdoParallelorg.Hs.eg.dbTxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/ririzarr/bumphunter
取决于我 minfi
进口我 brainflowprobes冠军DAMEfinderderfinderdmrseqepivizrGenomicStatemethylCCmethyvimrecountWorkflowrnaEditr
建议我 bigmelonderfinderPlotepivizrDataregionReport
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 bumphunter_1.32.0.tar.gz
Windows二进制 bumphunter_1.32.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) bumphunter_1.32.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bumphunter
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ bumphunter
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/bumphunter/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一: