Celaref

doi:10.18129/b9.bioc.celaref

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅Celaref

单细胞RNASEQ细胞群集通过参考标记

生物导体版本:3.12

在单细胞RNASEQ实验的聚类步骤之后,该软件包旨在根据与参考数据集的相似性建议簇的标签/单元格类型。它需要每个基因每个单元格的读数表,以及属于每个簇的单元格(用于测试和参考数据)。

作者:莎拉·威廉姆斯[AUT,CRE]

维护者:莎拉·威廉姆斯(Sarah Williams)

引用(从r内,输入引用(“ Celaref”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ calaref”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Celaref”)

html R脚本 手动的
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 Singlecell,,,,软件
版本 1.8.0
在生物导体中 Bioc 3.8(R-3.5)(2。5年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 3.5.0),总结性特征
进口 桅杆,,,,GGPLOT2,,,,矩阵,,,,dplyr,,,,马格里特,统计,utils,rlang,,,,生物基因,,,,S4VECTORS,,,,readr,,,,蒂布尔,,,,延迟
链接
建议 林玛, 平行,尼特,,,,rmarkDown,,,,实验室,,,,测试
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 calaref_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 calaref_1.8.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) Celaref_1.8.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/celaref
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/塞拉雷夫
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/celaref/
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