该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅Celaref。
生物导体版本:3.12
在单细胞RNASEQ实验的聚类步骤之后,该软件包旨在根据与参考数据集的相似性建议簇的标签/单元格类型。它需要每个基因每个单元格的读数表,以及属于每个簇的单元格(用于测试和参考数据)。
作者:莎拉·威廉姆斯[AUT,CRE]
维护者:莎拉·威廉姆斯(Sarah Williams)
引用(从r内,输入引用(“ Celaref”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ calaref”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Celaref”)
html | R脚本 | 手动的 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | Singlecell,,,,软件 |
版本 | 1.8.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.8(R-3.5)(2。5年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 3.5.0),总结性特征 |
进口 | 桅杆,,,,GGPLOT2,,,,矩阵,,,,dplyr,,,,马格里特,统计,utils,rlang,,,,生物基因,,,,S4VECTORS,,,,readr,,,,蒂布尔,,,,延迟 |
链接 | |
建议 | 林玛, 平行,尼特,,,,rmarkDown,,,,实验室,,,,测试 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | calaref_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | calaref_1.8.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | Celaref_1.8.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/celaref |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/塞拉雷夫 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/celaref/ |
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