嵌合体

DOI:10.18129 / B9.bioc.chimera

这个包裹是弃用．它可能会从Bioconductor中移除。详情请参阅包装寿命终止指南获取更多信息。

此包适用于Bioconductor 3.12版。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定发布版本，请参见嵌合体．

熔合产品的二次分析包

Bioconductor版本:3.12

这个包有助于融合产品事件的描述。支持从chimeraScan、bellerophontes、化解、FusionFinder、FusionHunter、mapSplice、tophat-fusion、FusionMap、STAR、Rsubread、fusionCatcher导入融合数据结果。

作者:Raffaele A Calogero, Matteo Carrara, Marco Beccuti, Francesca Cordero

维护者:Raffaele A Calogero < Raffaele。卡洛杰罗在unito， >

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("chimera")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“嵌合体”)

PDF	R脚本	嵌合体
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	基础设施，软件
版本	1.32.0
在Bioconductor	BioC 2.12 (R-3.0)(8年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	Biobase，GenomicRanges(> = 1.13.3),Rsamtools(> = 1.13.1),GenomicAlignments、方法、AnnotationDbi，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene，Homo.sapiens
进口
链接
建议	BiocParallel，geneplotter
SystemRequirements	STAR, TopHat，蝴蝶结和samtools的一些功能是必需的
增强了	Rsubread，BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9，TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene，BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10，TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.knownGene，Mus.musculus，BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene
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全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	chimera_1.32.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)	chimera_1.32.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chimera
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/chimera
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/chimera/
软件包下载报告	下载数据