chipseq

doi：10.18129/b9.bioc.chipseq

该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅chipseq。

Chipseq：用于分析Chipseq数据的软件包

生物导体版本：3.12

帮助处理Chipseq实验的简短阅读数据的工具

作者：Deepayan Sarkar，Robert Gentleman，Michael Lawrence，Zizhen Yao

维护者：bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ chipseq”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Chipseq”）

PDF	R脚本	样品芯片序列分析工作流程
PDF		参考手册

细节

生物浏览	chipseq，，，，覆盖范围，，，，DataImport，，，，QualityControl，，，，测序，，，，软件
版本	1.40.0
在生物导体中	Bioc 2.5（R-2.10）（11。5年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 2.10），方法，生物基因（> = 0.1.0），S4VECTORS（> = 0.17.25），iranges（> = 2.13.12），基因组机（> = 1.31.8），Shortread
进口	方法，统计，格子，，，，生物基因，，，，iranges，，，，基因组机，，，，Shortread
链接
建议	BSGENOME，，，，GenomicFeatures，，，，txdb.mmusculus.ucsc.mm9
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我	chipqc，，，，copywriter，，，，htseqgenie，，，，soggi，，，，transcriptr
建议我	Genogam
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	chipseq_1.40.0.tar.gz
Windows二进制	chipseq_1.40.0.zip（32-和64位）
MacOS 10.13（高山脉）	chipseq_1.40.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chipseq
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/chipseq
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/chipseq/
软件包下载报告	下载统计