彗星

doi：10.18129/b9.bioc.comet

该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅彗星。

彗星：范围循环范围范围扫描（EWAS）结果和DNA共甲基化模式的可视化

生物导体版本：3.12

EWA的可视化导致基因组区域。除了表型缔合p值外，彗星还生成了共甲基化模式的图，并提供了一系列注释轨道。只要数据可以转化为基因组水平和任何物种，它就可以用于其他范围内的关联扫描。

作者：Tiphaine C. Martin [AUT，CRE]，Thomas Hardiman [AUT]，IDIL [AUT]，PEI-CHIEN TSAI [AUT]，JORDANA T. BELL [AUT]

维护者：MSSM.edu的Tiphaine Martin

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ comet”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“彗星”）

PDF	R脚本	彗星用户指南
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	chipseq，，，，DNAMETHYLATY，，，，dnaseq，，，，差甲基化，，，，Exomeseq，，，，功能基因组学，，，，遗传学，，，，Genomewideassociation，，，，甲基，，，，甲基化array，，，，微阵列，，，，图案，，，，rnaseq，，，，核糖，，，，测序，，，，软件，，，，可视化
版本	1.22.0
在生物导体中	Bioc 3.1（R-3.2）（6年）
执照	GPL（> = 2）
要看	r（> = 3.6.0），网格，utils，Biomart，，，，GVIZ，，，，心理
进口	Colortools，，，，哈希，grdevices，栅格，，，，rtracklayer，，，，iranges，，，，S4VECTORS，，，，基因组机，统计Corrplot
链接
建议	生物使用，，，，尼特，，，，运行，，，，生物基因
系统要求
增强
URL	http://epigen.kcl.ac.uk/comet
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	comet_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	comet_1.22.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	comet_1.22.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/comet
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/彗星
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/comet/
软件包下载报告	下载统计