compartmap

DOI:10.18129 / B9.bioc.compartmap

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见compartmap．

从ATAC-seq和甲基化阵列数据推断A/B区

Bioconductor版本:3.12

Compartmap从ATAC-seq和甲基化阵列执行缩小A/B室推断。

作者:Benjamin Johnson [aut, cre]， Tim Triche [aut]， Kasper Hansen [aut]， Jean-Philippe Fortin [aut]

维护者:Benjamin Johnson

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“compartmap”)

超文本标记语言	R脚本	A/B隔间推断与隔间地图
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	ATACSeq，表观遗传学，遗传学，ImmunoOncology，MethylSeq，MethylationArray，软件
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 3.8 (R-3.5)(2.5年)
许可证	GPL-3 +文件许可证
取决于	R (>= 3.5.0)，minfi，Homo.sapiens，mixOmics
进口	SummarizedExperiment，GenomicRanges，gtools、并行
链接
建议	covr，testthat，knitr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/biobenkj/compartmap
BugReports	https://github.com/biobenkj/compartmap/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	compartmap_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	compartmap_1.8.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	compartmap_1.8.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/compartmap
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/compartmap
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/compartmap/
软件包下载报告	下载数据