conumee

DOI:10.18129 / B9.bioc.conumee

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见conumee．

使用Illumina DNA甲基化阵列进行增强拷贝数变异分析

Bioconductor版本:3.12

该软件包包含一组处理和绘图方法，用于使用Illumina 450k或EPIC甲基化阵列执行拷贝数变化(CNV)分析。

作者:Volker Hovestadt, Marc Zapatka

维护者:Volker Hovestadt

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("conumee")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“conumee”)

超文本标记语言	R脚本	conumee
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CopyNumberVariation，DNAMethylation，MethylationArray，微阵列，归一化，预处理，质量控制，软件
版本	1.24.0
在Bioconductor	BioC 3.1 (R-3.2)(6年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 3.0)，minfi，IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19，IlluminaHumanMethylation450kmanifest，IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b2.hg19，IlluminaHumanMethylationEPICmanifest
进口	方法、统计数据DNAcopy，rtracklayer，GenomicRanges，IRanges，GenomeInfoDb
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，minfiData，RCurl
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	CopyNeutralIMA
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	conumee_1.24.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)	conumee_1.24.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/conumee
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/conumee
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/conumee/
软件包下载报告	下载数据