Cydar

doi:10.18129/b9.bioc.cydar

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅Cydar

使用质量细胞仪进行差分丰度分析

生物导体版本:3.12

在质量细胞仪数据中鉴定样本和组之间的差异丰富种群。提供了将细胞计算为超球体,控制空间错误发现率的方法,并可视化高维标记空间中丰度的变化。

作者:Aaron Lun [AUT,CRE]

维护者:aaron lun

引用(从r内,输入引用(“ Cydar”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ cydar”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Cydar”)

html R脚本 检测差异丰度
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 流程仪,,,,免疫学,,,,多重组合,,,,蛋白质组学,,,,Singlecell,,,,软件
版本 1.14.1
在生物导体中 Bioc 3.5(R-3.4)(4年)
执照 GPL-3
要看 Singlecellexperiment
进口 维里迪斯, 方法,闪亮的,图形,统计,grdevices,utils,生物基因,,,,S4VECTORS,,,,生物比较,,,,总结性特征,,,,流核,,,,生物酶,,,,RCPP,,,,生物脑
链接 RCPP
建议 ncdfflow,,,,测试,,,,rmarkDown,,,,尼特,,,,EDGER,,,,林玛,,,,Glmnet,,,,生物使用,,,,FlowStats
系统要求 C ++ 11
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 cydar_1.14.1.tar.gz
Windows二进制 cydar_1.14.1.zip(32-和64位)
MacOS 10.13(高山脉) cydar_1.14.1.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cydar
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/cydar
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/cydar/
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