此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见命运.
Bioconductor版本:3.12
创建并绘制扩散图。
作者:菲利普·安格尔[cre, aut], Laleh Haghverdi [ctb], Maren Büttner [ctb],法比安·泰斯[ctb], Carsten Marr [ctb], Florian Büttner [ctb]
维护者:Philipp Angerer < Philipp。安格勒在helmholtz-muenchen.de >
引用(从R中,输入引用(“命运”)
):
要安装此包,启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“命运”)
Diffusion-Map-recap.pdf | ||
Diffusion-Maps.pdf | ||
DPT.pdf | ||
Gene-Relevance.pdf | ||
Global-Sigma.pdf | ||
tidyverse.pdf | ||
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | CellBasedAssays,CellBiology,聚类,软件,可视化 |
版本 | 3.4.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.2 (R-3.2)(5.5年) |
许可证 | GPL |
取决于 | R (> = 3.4.0) |
进口 | 方法,图形,grDevices, utils, stats,矩阵,Rcpp(> = 0.10.3),RcppEigen,RSpectra(0.14 > = 0),irlba,pcaMethods,Biobase,BiocGenerics,SummarizedExperiment,SingleCellExperiment,ggplot2,ggplot.multistats,tidyr,tidyselect,ggthemes,VIM,knn.covertree,代理,RcppHNSW,平滑,尺度,scatterplot3d |
链接 | Rcpp,RcppEigen, grDevices |
建议 | nbconvertR(> = 1.3.2),igraph,testthat,模糊神经网络,tidyr |
SystemRequirements | c++ 11, jupyter nbconvert(参见nbconvertR的安装文件) |
增强了 | rgl,SingleCellExperiment |
URL | https://theislab.github.io/destiny/https://github.com/theislab/destiny/https://www.helmholtz-muenchen.de/icb/destiny//www.andersvercelli.com/packages/destinyhttps://doi.org/10.1093/bioinformatics/btv715 |
BugReports | https://github.com/theislab/destiny/issues |
取决于我 | |
进口我 | ctgGEM,CytoTree,flowSpy,phemd |
建议我 | CellTrails,单片眼镜,嘘 |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | destiny_3.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | destiny_3.4.0.zip(32位和64位) |
macOS 10.13 (High Sierra) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/destiny |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/命运 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/destiny/ |
包下载报告 | 下载数据 |
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Bioconductor
支持»
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