epiNEM

DOI:10.18129 / B9.bioc.epiNEM

此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见epiNEM。

epiNEM

Bioconductor版本:3.12

epiNEM是原始嵌套效果模型(NEM)的扩展。EpiNEM能够考虑到双重敲除，并推断出更复杂的网络信号通路。

作者:Madeline Diekmann & Martin Pirkl

维护者:Martin Pirkl < Martin。pikl在bsse.ethz.ch>

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("epiNEM")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“epiNEM”)

超文本标记语言	R脚本	epiNEM
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	网络,NetworkInference,通路,软件,SystemsBiology
版本	1.14.1
在Bioconductor公司	BioC 3.5 (R-3.4)(4年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.4)
进口	BoolNet,e1071,gtools统计数据,igraph跑龙套,晶格,latticeExtra,RColorBrewer,pcalg,minetgrDevices,图,mnem
链接
建议	knitr,RUnit,BiocGenerics,STRINGdb,devtools,rmarkdown,GOSemSim,AnnotationHub,org.Sc.sgd.db
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	mnem
给我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	epiNEM_1.14.1.tar.gz
Windows二进制	epiNEM_1.14.1.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	epiNEM_1.14.1.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/epiNEM
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/epiNEM
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/epiNEM/
软件包下载报告	下载数据