epivizrChart

DOI:10.18129 / B9.bioc.epivizrChart

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见epivizrChart．

R接口到epiviz web组件

Bioconductor版本:3.12

这个包提供了一个API，用于使用epiviz web组件进行基因组数据的交互式可视化。R/BioConductor中的对象可以用来生成交互式R markdown/notebook文档，也可以在R Studio的默认查看器中可视化。

作者:Brian Gottfried [aut]， Jayaram Kancherla [aut]， Hector Corrada Bravo [aut, cre]

维护者:Hector Corrada Bravo

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("epivizrChart")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“epivizrChart”)

超文本标记语言	R脚本	epivizrChart简介
超文本标记语言	R脚本	使用epivizrChart可视化“rangesummarizeexperiment”对象
超文本标记语言	R脚本	使用epivizrChart可视化文件
超文本标记语言	R脚本	使用epivizrChart在Shiny app中可视化基因组数据
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GUI，软件，可视化
版本	1.12.0
在Bioconductor	BioC 3.6 (R-3.4)(3.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.4.0)
进口	epivizrData(> = 1.5.1),epivizrServer，htmltools，rjson、方法、BiocGenerics
链接
建议	testthat，roxygen2，knitr，Biobase，GenomicRanges，S4Vectors，IRanges，SummarizedExperiment，antiProfilesData，hgu133plus2.db，Mus.musculus，BiocStyle，Homo.sapiens，闪亮的，minfi，Rsamtools，rtracklayer，RColorBrewer，magrittr，AnnotationHub
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	epivizrChart_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	epivizrChart_1.12.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	epivizrChart_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epivizrChart
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/epivizrChart
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/epivizrChart/
软件包下载报告	下载数据