fcScan

DOI:10.18129 / B9.bioc.fcScan

此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见fcScan．

fsccan用于使用用户定义的选项检测坐标集群

Bioconductor版本:3.12

该包用于检测位于用户定义窗口大小内的基因组坐标组合，以及用户定义的已识别的相邻集群之间的重叠。它可以用于建立在特定染色体或特定链上的基因组数据。集群可以通过“贪婪”选项来执行，从而允许在允许的窗口大小内存在额外的站点。

作者:Abdullah El-Kurdi Ghiwa khalil Georges Khazen Pierre Khoueiry

维维者:Pierre Khoueiry Abdullah El-Kurdi

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“fcScan”)

超文本标记语言	R脚本	fcScan
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	聚类,GenomeAnnotation,软件
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 3.10 (R-3.6)(1.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于
进口	统计数据,plyr,VariantAnnotation,SummarizedExperiment,rtracklayer,GenomicRanges、方法、IRanges
链接
建议	RUnit,BiocGenerics,BiocStyle,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	fcScan_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	fcScan_1.4.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	fcScan_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fcScan
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ fcScan
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/fcScan/
包下载报告	下载数据