geneAttribution

DOI:10.18129 / B9.bioc.geneAttribution

此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见geneAttribution．

与遗传变异相关的候选基因的鉴定

Bioconductor版本:3.12

确定人类基因组中某一特定基因组位点的变异所通过的最有可能的一个或多个基因。最基本的功能假设基因越接近输入位点，该基因越有可能是致病基因。此外，如果以UCSC . bed文件格式提供，任何将基因组区域与基因联系起来的经验数据(例如eQTL或基因组结构数据)都可以使用。

作者:亚瑟·乌斯特

维护者:Arthur Wuster

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("geneAttribution")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“geneAttribution”)

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文本		新闻

细节

biocViews	GenePrediction，GenomeWideAssociation，GenomicVariation，单核苷酸多态性，软件，VariantAnnotation
版本	1.16.0
在Bioconductor公司	BioC 3.4 (R-3.3)(4.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于
进口	跑龙套,GenomicRanges，org.Hs.eg.db，BiocGenerics，GenomeInfoDb，GenomicFeatures，IRanges，rtracklayer
链接
建议	TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene，knitr，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	geneAttribution_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	geneAttribution_1.16.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	geneAttribution_1.16.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/geneAttribution
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/geneAttribution
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/geneAttribution/
软件包下载报告	下载数据