genefilter

DOI:10.18129 / B9.bioc.genefilter

此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见genefilter．

基因过滤器:从高通量实验中过滤基因的方法

Bioconductor版本:3.12

筛选基因的一些基本功能。

作者:R. Gentleman, V. Carey, W. Huber, F. Hahne

维护者:Bioconductor包维护者< Bioconductor .org>的维护者

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“genefilter”)

PDF	R脚本	附加图:独立过滤增加了检测差异表达基因的能力，Bourgon等人，PNAS (2010)
PDF	R脚本	如何找到与特定基因表达谱相似的基因
PDF	R脚本	使用基因过滤器功能从微阵列数据集中过滤基因
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	微阵列，软件
版本	1.72.1
Bioconductor自	BioC 1.6 (R-2.1)或更早的版本(> 16年)
许可证	艺术- 2.0
取决于
进口	BiocGenerics(> = 0.31.2),AnnotationDbi，注释，Biobase，图形，方法，统计，生存
链接
建议	类，hgu95av2.db，tkWidgets，所有，中华民国，RColorBrewer，BiocStyle，knitr
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	cellHTS2，CNTools，FlowSorted.Blood.EPIC，GeneMeta，Hiiragi2013，maEndToEnd，rnaseqGene，simpleaffy，SISPA，股东价值分析
进口我	a4Base，affyQCReport，阿尔卑斯山脉，annmap，arrayQualityMetrics，类别，cbaf，countsimQC，covRNA，DESeq，DESeq2，DEXSeq，eisa，ENmix，exomePeak2，GGBase，GISPA，GSRI，IHWpaper，JunctionSeq，metaseqR2，methyAnalysis，methylCC，methylumi，minfi，MLInterfaces，mogsa，NBAMSeq，pcaExplorer，PECA，phenoTest，pwrEWAS，林格，RNAinteractMAPK，simpleaffy，spatialHeatmap，tilingArray，XDE，zinbwave
建议我	AffyExpress，注释，ArrayTools，BiocCaseStudies，生命网络，BloodCancerMultiOmics2017，categoryCompare，ClassifyR，clusterStab，codelink，可乐，compcodeR，curatedBladderData，curatedCRCData，curatedOvarianData，DelayedArray，EnrichedHeatmap，factDesign，ffpe，ffpeExampleData，gageData，GenoGAM，GenomicFiles，GOstats，GSAR，GSEAlm，GSVA，logicFS，光民，MAQCsubset，MMUPHin，npGSEA，益生元，phyloseq，pvac，qpgraph，RforProteomics，rheumaticConditionWOLLBOLD，rtracklayer，siggenes，Single.mTEC.Transcriptomes，SSPA，TCGAbiolinks，topGO
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	genefilter_1.72.1.tar.gz
Windows二进制	genefilter_1.72.1.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	genefilter_1.72.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genefilter
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ genefilter
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/genefilter/
包下载报告	下载数据