此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见genomeIntervals.
Bioconductor版本:3.12
这个包定义了表示基因组区间的类,并提供了处理这些区间的函数和方法。注意:包提供了基本的基础设施,并由包“girafe”进行了增强。
作者:Julien Gagneur < Gagneur at in.tum.de>, Joern Toedling, Richard Bourgon, Nicolas Delhomme
维护人员:Julien Gagneur < Gagneur at in.tum.de>
引用(从R中,输入引用(“genomeIntervals”)
):
要安装此包,启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“genomeIntervals”)
R脚本 | genomeinterval包的概述。 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataImport,遗传学,基础设施,软件 |
版本 | 1.46.0 |
在Bioconductor公司 | BioC 2.4 (R-2.9)(12年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R(>= 2.15.0),方法,时间间隔(> = 0.14.0),BiocGenerics(> = 0.15.2) |
进口 | GenomeInfoDb(> = 1.5.8),GenomicRanges(> = 1.21.16),IRanges(> = 2.3.14),S4Vectors(> = 0.7.10) |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | girafe |
进口我 | easyRNASeq |
建议我 | |
给我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | genomeIntervals_1.46.0.tar.gz |
Windows二进制 | genomeIntervals_1.46.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | genomeIntervals_1.46.0.tgz |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/genomeIntervals |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ genomeinterval |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/genomeIntervals/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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