genomeIntervals

DOI:10.18129 / B9.bioc.genomeIntervals

此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见genomeIntervals

基因组间隔操作

Bioconductor版本:3.12

这个包定义了表示基因组区间的类,并提供了处理这些区间的函数和方法。注意:包提供了基本的基础设施,并由包“girafe”进行了增强。

作者:Julien Gagneur < Gagneur at in.tum.de>, Joern Toedling, Richard Bourgon, Nicolas Delhomme

维护人员:Julien Gagneur < Gagneur at in.tum.de>

引用(从R中,输入引用(“genomeIntervals”)):

安装

要安装此包,启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“genomeIntervals”)

PDF R脚本 genomeinterval包的概述。
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataImport遗传学基础设施软件
版本 1.46.0
在Bioconductor公司 BioC 2.4 (R-2.9)(12年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R(>= 2.15.0),方法,时间间隔(> = 0.14.0),BiocGenerics(> = 0.15.2)
进口 GenomeInfoDb(> = 1.5.8),GenomicRanges(> = 1.21.16),IRanges(> = 2.3.14),S4Vectors(> = 0.7.10)
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 girafe
进口我 easyRNASeq
建议我
给我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 genomeIntervals_1.46.0.tar.gz
Windows二进制 genomeIntervals_1.46.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) genomeIntervals_1.46.0.tgz
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/genomeIntervals
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ genomeinterval
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/genomeIntervals/
软件包下载报告 下载数据

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